主合同无效时补充协议的效力需结合具体情况判断，并非一概无效或有效。
主合同无效时补充协议通常不生效，但存在例外情形。

1. 若补充协议是对主合同无效后的结算、清理等独立事项作出约定，且内容不违反法律强制性规定，则补充协议可能独立生效。
2. 若补充协议仅针对主合同中部分条款的修改或补充，未脱离主合同的基础权利义务关系，则主合同无效时补充协议一般随主合同无效。
3. 若双方在补充协议中明确约定“主合同无效时本补充协议仍有效”，且该约定不违反法律强制性规定，法院可能认可其独立性。
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主合同无效时补充协议效力问题，可能存在以下法律风险：
1. 补充协议被认定无效的风险：若补充协议未约定独立性且不属于结算清理条款，主合同无效后补充协议将随之一并无效，导致当事人基于补充协议的预期利益无法实现。例如，甲与乙签订主合同约定合作项目，补充协议约定项目终止后的赔偿金额，后主合同因违法被认定无效，若补充协议未明确独立生效，则该赔偿约定也无效，甲无法依据补充协议主张赔偿。
2. 证据不足的风险：若当事人未保存补充协议独立性的证据（如沟通记录），在诉讼中难以证明补充协议属于结算清理条款，可能导致法院不认可其效力。例如，丙与丁签订补充协议时口头约定“主合同无效时补充协议仍有效”，但未书面记录，诉讼时丁否认该约定，丙因证据不足败诉。
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主合同无效时判断补充协议效力，需避免以下常见错误操作：
1. 直接认定补充协议无效：部分当事人认为主合同无效则补充协议必然无效，忽视补充协议可能属于独立结算清理条款的情形，导致自身合法权益受损。
2. 擅自修改补充协议：发现主合同无效后，未与对方协商即自行修改补充协议内容，可能因缺乏双方合意导致修改后的协议不生效。
3. 忽视证据收集：未保存双方关于补充协议签订目的的沟通记录，无法证明补充协议的独立性，在后续争议中难以举证。

若您已出现上述错误操作，或对补充协议效力仍有疑问，可进一步向我们咨询，获取专业法律帮助。
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针对主合同无效时补充协议的效力问题，我们可依据相关法律规定进行具体分析。
根据《中华人民共和国民法典》第五百一十条规定：“合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。” 补充协议本质是对主合同的变更或补充，以主合同有效为前提。但《民法典》第五百六十七条规定：“合同的权利义务关系终止，不影响合同中结算和清理条款的效力。” 若补充协议属于结算、清理条款范畴，即使主合同无效，其仍可能独立生效。因此，主合同无效时补充协议原则上不生效，但符合独立结算清理条款等例外情形的除外。

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